Graft-versus-host hastalığı (GvHD) çeşitli organları etkileyebilir, bunlar arasında: 1. Cilt: Döküntüler, kızarıklık, kaşıntı, deri soyulması ve kabarcıklar oluşabilir. 2. Gastrointestinal sistem: İshal, bulantı, karın krampları, iştah kaybı ve kilo kaybı görülebilir. 3. Karaciğer: Karaciğer iltihabı, sarılık, karaciğer fonksiyon bozuklukları ve karın hassasiyeti ortaya çıkabilir. 4. Akciğerler: Nefes darlığı, öksürük ve göğüs ağrısı gibi solunum problemleri yaşanabilir. 5. Gözler: Kuru gözler, ışığa duyarlılık ve görme bozuklukları oluşabilir. 6. Ağız ve genitals: Ağız içinde yaralar, mantar enfeksiyonları, kuruluk ve ağrılı cinsel ilişki görülebilir.