Alisaray köyünün hikayesi, köy yaşlıları tarafından anlatılan bir efsaneye dayanmaktadır. Durmuş Oğulları sülalesinden, padişahın yanında at tımarcısı olarak çalışan bir kişi, padişahtan Alisaray köyüne camii yaptırmak için yardım ister. Ayrıca, köyün kuzeyinde Mashar Oluğu Kalesi ve güneyinde Örem mevkiinde ortaya çıkan kalıntılar, Alisaray'ın antik çağlarda da yerleşim yeri olarak kullanıldığını göstermektedir. Köyün adının, "köylülerin mağara dedikleri, tarihi bilinmeyen, toprak altında kalmış bir saray yıkıntısından" almış olabileceği de düşünülmektedir.