Virüslü dosyalar, virüsün bilgisayara yayılmasını veya bulaşmaya devam etmesini önlemek için karantinaya alınır. Karantina, dosyanın aşağıdaki durumlarda izole edilmesini sağlar: Dosya kodu, bilinen veya kısmen değiştirilmiş bir kötü amaçlı programa benziyorsa ve zararlı yazılıma benzer bir yapıya sahipse. Dosyanın gerçekleştirdiği işlem dizisi tehlikeliyse. Karantinadaki bir dosya, önemli bir kişisel dosya olmadığı sürece bilgisayara daha fazla zarar veremez. Ancak, dosyanın virüslü olmadığından %100 emin olunduğunda, karantina klasöründen geri yüklenmesi mümkündür.