İl özel idaresi genel sekreteri, il özel idaresi hizmetlerini vali adına ve onun emirleri doğrultusunda yürütür. Bu kapsamda: Mevzuat ve stratejik planlara uygun yönetim: İl özel idaresinin faaliyetlerini, mevzuat hükümlerine, il genel meclisi ve il encümeni kararlarına, stratejik plan ve yıllık çalışma programına göre düzenler. Emirlerin uygulanması: İl özel idaresi kuruluşlarına gereken emirleri verir ve bunların uygulanmasını sağlar. Denetim ve koordinasyon: İl özel idaresi, bağlı kuruluşları ve işletmelerinin denetimini yapar. Bütçe ve mali işler: Bütçenin uygulanmasını sağlar, bütçede meclis ve encümenin yetkisi dışındaki aktarmaları yapar. Personel yönetimi: İl özel idaresi personelini atar ve yönetir. Genel sekreter, yukarıda belirtilen hizmetlerin yürütülmesinden valiye karşı sorumludur.