Ayçiçekte kullanılan bazı ilaçlar şunlardır: Yabancı ot ilaçları: Intervix Plus; Imazamox; Tribenuron Methyl. Hastalık ve zararlılarla mücadelede kullanılan ilaçlar: Metalaxyl (mildiyö hastalığına karşı); Arrivo 25 EC, Deltharin 2,5 EC, Barrier 35 DS, Herbimat 330 EC, Primero 450 CS, Bonaflan WG, Lescano, Hektaş Mentor, Neria 25 SL, Elpis, Formula Super 5 EC. İlaç kullanımı, yabancı ot türüne ve ayçiçeğinin fenolojik dönemine göre değişiklik gösterebilir. İlaç kullanımı öncesinde bir tarım uzmanına danışılması önerilir.