Pancar şekerinin zararları hakkında bilgi bulunamadı. Ancak, genel olarak şekerin aşırı tüketiminin sağlık sorunlarına yol açabileceği bilinmektedir. Aşırı şeker tüketiminin bazı zararları: Obezite ve diyabet: Fazla şeker kilo alımına ve tip 2 diyabet gibi hastalıklara neden olabilir. Kalp hastalıkları: Yüksek şeker alımı, kan basıncının ve trigliserit değerlerinin yükselmesine, kolesterol seviyelerinin kötüleşmesine yol açarak kalp hastalıkları ve felç riskini artırabilir. Diş çürükleri: Şeker, ağızda bakteri üremesine neden olarak diş çürüklerine yol açabilir. Bağışıklık sistemi: Şeker, bağışıklık sistemini zayıflatarak enfeksiyonlara karşı direnci düşürebilir. Enflamasyon: Fazla şeker tüketimi vücutta enflamasyonun artmasına neden olabilir, bu da kronik hastalıkların gelişimini hızlandırabilir.