Fondüde kullanılan bazı peynir çeşitleri: Peynir fondü için klasik olarak Gruyère, Emmental ve Appenzeller peynirleri kullanılır. Farklı lezzetler için Cheddar, Gouda veya Parmesan gibi peynirler de tercih edilebilir. Peynir fondü tarifi için gerekli malzemeler: 1 diş sarımsak; 125 g eski kaşar peyniri; 125 g Kars gravyer peyniri; 125 g çedar peyniri; 150 ml süt; 2 yemek kaşığı un; Tuz, karabiber; 1 çay kaşığı rendelenmiş muskat cevizi. Fondü yaparken özel bir fondü tenceresi ve uzun saplı çatallar gereklidir.