Karabuğday ekmeği, genel olarak sağlıklı bir besin olarak kabul edilir. İşte bazı faydaları: Gluten içermez. Lif oranı yüksektir. Düşük glisemik indekse sahiptir. Protein, mineral ve vitaminler açısından zengindir. Ancak, karabuğday ekmeğinin besin değeri, yapımında kullanılan diğer malzemelere bağlı olarak değişebilir.