Pnömoniye (zatürre) neden olan başlıca mikroplar şunlardır: 1. Bakteriler: En yaygın pnömoni nedeni bakteriyel enfeksiyonlardır ve özellikle Streptococcus pneumoniae adlı bakteri sık görülür. 2. Virüsler: Grip (influenza) virüsü, RSV (respiratuar sinsityal virüs), insan metapnömovirüsü ve parainfluenza virüsü gibi virüsler de pnömoniye neden olabilir. 3. Mantarlar: Nadir durumlarda, özellikle bağışıklık sistemi zayıflamış bireylerde Pneumocystis jirovecii gibi mantarlar pnömoniye yol açabilir. Ayrıca, aspirasyon (yiyecek veya kusmuk gibi maddelerin akciğerlere kaçması) ve kimyasalların solunması da pnömoniye neden olabilir.