Çiçek aşısı, genellikle vaccinia virüsü adı verilen canlı, ancak hastalığa neden olmayan bir virüs kullanılarak uygulanır. Uygulama yöntemleri şunlardır: 1. Enjeksiyon: Aşı, cilt altına (subkutan) veya kas içine (intramüsküler) enjeksiyon yoluyla yapılır. 2. Aşı Yeri: Genellikle omuz bölgesine uygulanır ve bu bölgede küçük bir yara izine neden olur. Uygulama takvimi ve kimler için gerekli olduğu konusunda kesin kararlar için bir sağlık profesyoneline danışmak önemlidir. Çiçek aşısının günümüzde rutin olarak uygulanmamasının nedeni, çiçek hastalığının 1980 yılında dünya genelinde tamamen yok edilmiş olmasıdır.