Başlıca sebepler:
- Pagan inançları: Hypatia'nın pagan olması ve Hristiyanlık karşıtı faaliyetleri, Hristiyan din adamları tarafından hedef alınmasına yol açtı 13.
- İskenderiye Valisi Orestes ile ilişkisi: Hypatia'nın, Vali Orestes ile yakın olması ve onun "gerçek inancı" kabul etmesini engellemesi, Cyril gibi Hristiyan yetkililer tarafından eleştirildi 23.
- Halk üzerindeki etkisi: Hypatia'nın halk arasında popüler olması ve öğrencileri arasında ileri gelen isimlerin bulunması, onun bir "tökezleme taşı" olarak görülmesine neden oldu 2.
5 kaynaktan alınan bilgiyle göre: