Kromozomların eşlenmesi, hücre bölünmesi sırasında mitoz ve mayoz bölünme süreçlerinde gerçekleşir. Mitoz bölünmede kromozomların eşlenmesi şu şekilde olur: 1. İnterfaz evresi: Hücre bölünmeye hazırlanır, DNA ve sentrozom kopyalanır. 2. Profaz evresi: DNA'nın proteinlerle oluşturduğu yapı olan kromatin yoğunlaşarak kıvrılır ve kromozomları oluşturur. 3. Metafaz evresi: Mikrotübüllerin oluşturduğu iğ ipliklerine bağlı kromozomlar hücrenin ortasına dizilir. 4. Anafaz evresi: Kardeş kromatitler iğ iplikleri tarafından zıt kutuplara çekilir. 5. Telofaz evresi: Kromozomların etrafında çekirdek zarı yeniden oluşur, kromozomlar çözülür ve sitokinez başlar. Mayoz bölünmede kromozomların eşlenmesi ise şu şekildedir: 1. Profaz-1 evresi: Kromozomlar ikili çiftler hâlinde eşleşir (homolog kromozomlar) ve krossing over adı verilen gen alışverişi gerçekleşir. 2. Metafaz-1 evresi: Homolog kromozomlar rastgele dizilerek iğ ipliklerine bağlanır. 3. Anafaz-1 evresi: Homolog kromozomlar zıt kutuplara çekilir. 4. Telofaz-1 evresi: Kromozomların kutuplara çekilmesi tamamlanır, bazı canlılarda çekirdek zarı yeniden oluşur ve sitokinez başlar.