Çanakkale'nin jeolojik yapısı, dört ana zaman dilimine ayrılmış kayaçlardan oluşur: 1. 1. Zaman (Paleozonik): Bu topraklar, özellikle killi şist ve mermerlerden oluşur ve Karabiga'nın batısındaki yörede bulunur. 2. 2. Zaman (Mezozoik): Mermerleşmiş kalkerler, kum, taş, kil ve şistlerden oluşur ve Anafartalar limanı ile Kireçtepe yörelerini kaplar. 3. 3. Zaman (Neozoik): Bu topraklar, Çan İlçesi'nin kuzeybatısındaki Hamdibey Bucağı çevresi ile Çanakkale Boğazı'nın her iki yakasını kapsar ve killi, marnlı, kumlu ve mikalıdır. 4. 4. Zaman (Kuvaterner): Çayların taşıdığı alüvyonlarla kaplı alanlardır ve taban suyu bakımından zengindir. Ayrıca, Lapseki-Biga arasında andezitler ve Ayvacık, Babakale ve Ezine arasında büyük volkanik külte alanları da bulunur.