Üniversite hastanelerinde bulunan bazı bölümler şunlardır: Cerrahi Bölümler: Kalp ve damar cerrahisi, genel cerrahi, beyin ve sinir cerrahisi, ortopedi ve travmatoloji, plastik cerrahi. Tıbbi Bölümler: Dahiliye (iç hastalıkları), enfeksiyon hastalıkları, nöroloji, göz hastalıkları, fiziksel tıp ve rehabilitasyon, gastroenteroloji. Kadın Sağlığı ve Doğum: Kadın hastalıkları ve doğum. Çocuk Sağlığı: Çocuk sağlığı ve hastalıkları, çocuk cerrahisi, çocuk psikiyatrisi. Diğer Bölümler: Kulak-burun-boğaz hastalıkları, üroloji, radyoloji, psikiyatri. Ayrıca, üniversite hastanelerinde tıbbi genetik, radyasyon onkolojisi, kemik yoğunluğu ölçümü gibi daha spesifik alanlar da bulunabilir.