ELISA yöntemi ile teşhis edilen bazı hastalıklar: Enfeksiyon hastalıkları: HIV/AIDS, hepatit B ve C, kızamık, kızamıkçık, kabakulak, sifiliz, bruselloz, tüberküloz, Lyme hastalığı. Otoimmün hastalıklar: Romatoid artrit, sistemik lupus eritematozus (SLE), çölyak hastalığı. Alerjiler: Gıda alerjileri, polen alerjisi, ev tozu alerjisi. Hormon ölçümü: Tiroid hormonları, gebelik hormonu (hCG). Kanser: Prostat kanseri (PSA), over kanseri (CA-125). ELISA testi, ayrıca bazı paraziter enfeksiyonların tanısında da kullanılır.