Deniz akvaryumu bakımı zor değildir, ancak dikkat edilmesi gereken bazı önemli noktalar vardır. Düzenli bakım gerektiren bazı unsurlar: Su kalitesi: Sıcaklık, ışıklandırma, protein skimmer ve su seviyesi günlük olarak kontrol edilmelidir. Tuzluluk ve yoğunluk: Tuzluluk, pH değeri, nitrat, karbonat sertliği gibi değerler haftalık olarak kontrol edilmeli ve ayarlanmalıdır. Filtre ve ekipman bakımı: Sump ve sirkülasyon motorları ayda bir tatlı su ile yıkanmalı, 6 ayda bir aydınlatma sistemi kontrol edilmelidir. Su değişimi: Ayda %10 oranında su değişimi yapılmalıdır. Bu bakımlar yapıldığında, deniz akvaryumu biyolojik dengesini koruyacak ve canlılar sağlıklı bir şekilde yaşayacaktır.