Hayvanların evcilleştirilmesi, etik açıdan sorgulanabilir uygulamalar içerebilir. Bazı etik sorunlar: Genetik çeşitlilik azalması ve sağlık sorunları: Seçici çiftleştirme, genetik çeşitliliği azaltarak sağlık sorunlarına yol açabilir. Hayvanların refahı: Evcilleştirme sürecinde hayvanların doğal yaşam alanları yok edilebilir ve insan ihtiyaçlarına göre yeniden şekillendirilebilir, bu da hayvanların refahını olumsuz etkileyebilir. İnsan merkezli yaklaşım: Evcilleştirme, genellikle insan çıkarlarını merkeze alarak hayvanların özerkliğini kısıtlar ve onları maddi bir kaynak olarak görür. Ancak, evcilleştirme aynı zamanda insanların besin kaynağı yaratma, taşımacılık ve sadık yoldaşlar elde etme gibi ihtiyaçlarını da karşılamıştır. Evcilleştirme sürecinin etik boyutları, günümüzde de tartışılmaya devam etmektedir.