Apolloniya'nın hikayesi iki ana bölümde incelenebilir: antik kent ve mitolojik tanrı. Antik Apolloniya: Apolloniya, MÖ 600 civarında Korint ve Korcyra'dan gelen Yunan kolonistler tarafından İlirya'nın güneyindeki stratejik bir konumda kurulmuştur. Apolloniya, ticari bir merkez olarak hızla gelişti ve Roma Cumhuriyeti ile ittifak kurarak önemli bir askeri üs haline geldi. Mitolojik Apollon: Apollon, Yunan mitolojisinin en önemli tanrılarından biridir ve sanat, müzik, kehanet, aşk ve intikam gibi çeşitli alanlarda rol oynar. En bilinen hikayelerinden bazıları şunlardır: Dafni ile olan aşkı: Aşk tanrısı Eros'un oklarından birine hedef olan Apollon, Dafni'ye aşık olur. Marsyas ile olan yarışması: Apollon'un müzik yeteneğini sergilediği bu hikayede, bir satir olan Marsyas'ı flüt çalmada yener ve cezalandırmak için onu canlı canlı derisini yüzer. Python ile olan mücadelesi: Apollon, annesi Leto'yu kovalayan Python adlı dev yılanı öldürerek Delphi'de bir tapınak kurar.