Aile hekimliği denetlemeleri, Kurum (Türkiye Halk Sağlığı Kurumu), ilgili mülki idare amirleri (Vali/Kaymakam) ve yerel sağlık idare amirleri (İstanbul Halk Sağlığı Müdürlüğü) veya bunların görevlendireceği personel tarafından gerçekleştirilir. Denetleme süreci şu şekilde işler: Denetlemeye gelen ekibin, İstanbul Halk Sağlığı Müdürlüğü tarafından düzenlenmiş ve olağan dışı denetimin sebebini içeren görevlendirme yazısı bulunmalıdır. Denetimde, “ASM ve AHB’nin Olağan Dışı Durum, İhbar ve Şikayetlerinde Kullanılacak Denetim Formu ve İnceleme Tutanağı” kullanılır. Denetim ekibi, sadece denetimin nedenini belirten konuyla sınırlı inceleme yapabilir. Hasta haklarına riayet edilerek kayıtlı kişilerin dosyaları incelenebilir, ancak kayıtların örnekleri talep edilemez. Denetimin usul ve esaslarına aykırı hareket edilmesi durumunda, bu aykırılıklar Denetim Formu’na şerh olarak yazılır. Denetlemeler, Kurum tarafından belirlenen denetim formları ile yapılır.