Cin mısırın farkı, diğer mısır alt türlerinden şu özelliklerle ayrılır: 1. Boyut ve Sertlik: Bitki boyu daha kısa, yaprak, koçan ve tane boyutu daha küçük ve serttir. 2. Kullanım Alanı: Çoğunlukla insan gıdası olarak patlatılmış (popcorn) mısır şeklinde çerez olarak tüketilir ve az miktarda şekerleme ürünleri sanayinde kullanılır. 3. Renk Değişimi: Tanelerinde diğer mısır türlerine göre daha fazla renk değişimi olur ve renkleri beyaz, sarı, kırmızı, mor, siyah ve ara formlarında olabilir. 4. Kabuk Yapısı: Diğer alt türlere göre daha kalın ve sert bir kabuğa sahiptir.