Alt Üst Böreği'nin içine şu malzemeler konur: İç harcı için: 1 kilogram pırasa; 250 gram kıyma; yarım su bardağı sıvı yağ; 1 çay kaşığı tuz; 1 çay kaşığı karabiber; 1 çay kaşığı kırmızı toz biber. Üzeri için: 2 yemek kaşığı yoğurt; 1 yemek kaşığı sıvı yağ. Ayrıca, iç harç olarak rendelenmiş domates de kullanılabilir. Tariflerde verilen kıymalı ve pırasalı harç yerine, peynirli, patatesli, ıspanaklı veya mercimekli harçlar da kullanılabilir.