HBeAg pozitifliği, genellikle akut enfeksiyonun iyileşmesi sırasında, HBsAg'nin negatifleşmesinden yaklaşık 3 hafta önce kaybolur. Kronik enfeksiyonda, HBeAg'nin serokonversiyonu (HBeAg'nin negatifleşip, Anti-HBe antikorlarının pozitif hale gelmesi) gerçekleşir ve bu, bulaştırıcılık eğiliminin azaldığını gösterir. HBeAg pozitifliğinin ne zaman düzeleceği, enfeksiyonun türüne ve kişinin bağışıklık durumuna bağlı olarak değişiklik gösterebilir. Kesin süre için bir sağlık uzmanına danışılması önerilir.