Antikorlar, antijenleri çeşitli yollarla yok eder: Nötralizasyon: Antikorlar, antijenlerin (virüs veya toksin) hücrelere bağlanmasını engelleyerek onları etkisiz hale getirir. Opsonizasyon: Antijenleri işaretleyerek bağışıklık hücrelerinin onları daha kolay tanımasını ve yok etmesini sağlar. Kompleman sistemini aktive etme: Antijen-antikor kompleksleri, kompleman sistemi adı verilen bir bağışıklık mekanizmasını tetikleyerek patojenlerin yok edilmesini sağlar. Aglütinasyon: Birden fazla antijen molekülünü bir araya getirerek kümeler oluşturur ve bağışıklık hücrelerinin bu kümeleri etkisiz hale getirmesini kolaylaştırır.