Göbeklitepe'deki semboller, T biçimindeki dikilitaşlar üzerinde yer alır ve genellikle hayvan, insan ve soyut motifler içerir. Bu sembollerin tam anlamı kesin olarak bilinmemekle birlikte, bazı olası yorumlar şunlardır: Hayvan motifleri, bölgedeki faunayı yansıtır ve saldırgan özellikleri temsil eder. Boğa motifi, üretkenliği simgeler. Turna motifi, Hermes'in öğretisini ve birçok kültürdeki turna dansını temsil eder. Kabartmalar, şaman ritüelleri ve ayinlerle ilişkilendirilir; şamanların bu sembolleri çizerek kendilerini transa geçirdikleri düşünülür. Ayrıca, Göbeklitepe'deki sembollerin, dünyanın bilinen en eski megalitleri olan taş sütunlarla birlikte, bir kült merkezinin mimari unsurlarını oluşturduğu da kabul edilir.