E-defter uygulamasına geçişte üç ay kuralı, aşağıdaki durumlarda uygulanır: 1. Tam bölünme, birleşme veya tür değişikliği: Bu işlemlere tabi olan mükellefler, işlemin ticaret siciline tescil tarihini takip eden ayın başından itibaren en geç 3 ay içinde e-defter uygulamasına geçmek zorundadır. 2. Yeni kurulan ticaret şirketi: E-defter uygulamasına dahil olan veya dahil olmak zorunda olan bir gerçek kişi mükellefin ticaret şirketine dönüşmesi halinde, yeni kurulan ticaret şirketi de aynı süre içinde e-defter uygulamasına geçmek zorundadır. Bu kurallar, mükelleflerin geçiş hazırlıklarını yapabilmeleri için yeterli süreyi sağlamak amacıyla belirlenmiştir.