Reform, skolastisizm üzerinde çeşitli etkiler yaratmıştır: Eleştirel Düşüncenin Yükselişi: Reform, Martin Luther ve John Calvin'in öncülüğünde, skolastik düşüncenin Katolik Kilisesi ile olan güçlü bağlarını sorgulamış ve dinî otoriteye dayalı felsefenin etkisini azaltmıştır. Protestan Skolastisizminin Doğuşu: Reform, "Reformcu Skolastisizm" veya "Reformcu Ortodoksluk" gibi düşünce yönlerinin ortaya çıkmasına yol açmıştır. Modern Düşüncenin Temeli: Skolastik düşünce, modern bilim ve felsefenin gelişimine zemin hazırlamıştır. Ancak, 17. yüzyılın sonlarına doğru skolastik düşünce entelektüel anlamda sona ermiştir.