Şifahanelerde yapılan tedaviler, İslam tıbbının çeşitli yöntemlerini içeriyordu: 1. İlaç Tedavisi: Şifahanelerde, bitkisel ilaçlar ve doğal reçeteler kullanılarak hastalıkların tedavisi yapılırdı. 2. Psikoterapi: Müziğin ve namelerin hastalar üzerinde rahatlatıcı etkisi olduğu düşünülerek, bu yöntemler de tedavi amaçlı kullanılırdı. 3. Cerrahi Operasyonlar: Ez-Zehrâvî gibi tabipler, ortopedik ameliyatlar, rahim ameliyatları ve mesanedeki taşların ameliyat yoluyla çıkarılması gibi cerrahi müdahaleler gerçekleştirirdi. 4. Koruyucu Hekimlik: Er-Râzî, koruyucu hekimlik konusunda önemli tespitler yapmış ve hastaların ilaç alırken tiksinmeden kullanabilecekleri hoş kokulu ve lezzetli ilaçlar üretmiştir. Ayrıca, Kur'an-ı Kerim ve dua da şifa arayışında kullanılan manevi yöntemler arasındaydı.