Bakteriler, antibiyotiklere çeşitli yollarla direnç kazanabilir: Doğal direnç: Bakterinin yapısı, antibiyotiğin etki etmesini engelleyebilir. Genetik değişim (mutasyon): Bakteriler çoğalırken oluşan mutasyonlar, antibiyotiklerin etki ettiği proteinleri değiştirebilir. Gen transferi: Direnç genleri, plazmitler aracılığıyla bir bakteriden diğerine aktarılabilir. Antibiyotik direnci, bakterilerin hayatta kalma mücadelesi olarak da görülebilir.