Kalıtsal mutasyon, bireyin üreme hücrelerinde (sperm veya yumurta hücrelerinde) meydana gelen mutasyonlardır ve bu nedenle nesilden nesile aktarılabilir. Kalıtsal mutasyonların oluştuğu bazı durumlar: Mayoz bölünme sırasında: Mayoz bölünme sırasında eş kromozomların bölünmemesi, kromozomların yanlış dağılımına ve trizomi veya monozomi oluşumuna yol açabilir. Döllenme sırasında: Üreme hücrelerindeki DNA değişiklikleri döllenme sırasında aktarılırsa, yeni bireyin tüm hücrelerinde bu mutasyon yer alır. Kalıtsal mutasyonlar, genellikle doğrudan bir sonraki nesle geçebildiğinden, aynı mutasyonu taşıyan çok sayıda aile bireyiyle karşılaşılmasına yol açabilir.