Histon proteini, ökaryotik hücrelerde DNA'nın düzenlenmesi ve yapısal organizasyonu için kritik öneme sahiptir. Başlıca işlevleri şunlardır: 1. Kromatin yapısının oluşumu: DNA'nın etrafında sarılarak nükleozomları oluşturur ve bu yapılar kromatin adı verilen daha büyük yapıları meydana getirir. 2. Gen ifadesinin düzenlenmesi: Histon modifikasyonları (asetilasyon, metilasyon, fosforilasyon gibi) genlerin aktif veya pasif hale gelmesine katkıda bulunur. 3. DNA onarımı: Hasar gören DNA bölgelerinin açılmasında rol oynayarak onarım mekanizmalarının erişimine izin verir. 4. Kromozomların dağıtımı: Hücre bölünmesi sırasında kromozomların düzgün bir şekilde ayrılmasını sağlar.