Modifikasyon ve mutasyon arasındaki temel farklar şunlardır: 1. Gen Yapısı: Modifikasyonda genlerin yapısında değişiklik olmaz, sadece işleyişlerinde değişiklik meydana gelir. 2. Kalıtsallık: Modifikasyonlar kalıtsal değildir, sonraki nesillere aktarılmaz. 3. Etkenler: Modifikasyonlara çevre şartları (besin, ısı, basınç, nem vb.) etki ederken, mutasyonlara X ışını, radyasyon, kimyasal maddeler gibi faktörler neden olur. 4. Değişim Türü: Modifikasyonlar canlının fenotipini değiştirirken, mutasyonlar hem fenotip hem de genotipi değiştirir.