Atomların mikroskobik görüntülerde bulanık görünmesinin nedeni, atomların çok küçük olması ve ışık dalgalarının bu boyutları çözemeyecek kadar büyük olmasıdır 14.

Optik mikroskoplar, atomları görmek için yeterli çözünürlüğe sahip değildir; çünkü bir şeyi görmek için aydınlatan ışığın dalga boyunun, görüntülenmek istenen cismin boyutundan küçük olması gerekir 1.

Atomların bulanık görünmesinin bir diğer nedeni de kuantum tünelleme olarak adlandırılan bir olgudur 1. Bu durum, belirsizlik ilkesi nedeniyle elektronların rastgele sıçramalar yaparak atomlar arasında boşluklara düşmesine yol açar 1. Bu, görüntünün tek tek atomları seçemeyecek kadar bulanık olmasına neden olur 1.

Atomların detaylı görüntülenmesi için taramalı tünel mikroskobu gibi özel mikroskoplar kullanılır 14. Bu mikroskoplar, elektronların yüzeydeki hareketlerinden yararlanarak atomik düzeyde görüntüler oluşturur 4.