TUSem mikrobiyoloji dersinin zorluğu, diğer TUS dersleriyle benzer şekilde, geniş teorik yükü ve pratik uygulamaların gerekliliği nedeniyle yüksek olarak değerlendirilmektedir. Mikrobiyoloji soruları, TUS sınavındaki temel bilimler testinin %9'unu oluşturmaktadır ve son 10 sınavda en çok sorunun geldiği konular arasında temel mikrobiyoloji, bakteriyoloji ve viroloji bulunmaktadır.