Ahmet Özer'in yazdığı makaleler genellikle kentleşme, yerel yönetimler, göç, siyaset sosyolojisi, toplumsal yapı ve değişim, küreselleşme, Kürt sorunu ve çatışmaların çözümü gibi konuları ele almaktadır. Özer'in bazı makale konuları: "11 Eylül, bölünen dünya, Huntington ve çatışma"; "Türkiye’de 2001-2005 yılları arasında kistik ekinokokkozis"; "Beş büyük tarihi kavşakta Kürtler ve Türkler: tarihsel gerçek, sosyolojik durum, demokratik çözüm"; "Doğu'da aşiret düzeni ve Brukanlar"; "Küreselleşme ve Yeni Dünya Düzeni Karşısında İnsan Haklarının Durumu". Ayrıca, Özer'in makaleleri yapikrediyayinlari.com.tr gibi platformlarda da yer almaktadır.