Femoflor testi, genellikle şu amaçlarla yapılır: Ürogenital sistemin mikrobik florasının durumunu öğrenmek. Şüpheli cinsel ilişki sonrası, herhangi bir cinsel yolla bulaşan enfeksiyon etkenlerinin varlığını tespit etmek. Gebelik planlaması, jinekolojik cerrahi müdahaleler öncesi ve sonrası. Tekrarlayan enfeksiyonlar ve etkisiz tedavi durumlarında. Vajinal rahatsızlık, kaşıntı, yanma veya patolojik akıntı şikayetlerinde. Ayrıca, kısırlık, düşük, düşük ve erken doğum anamnezi olan kadınlara da Femoflor testi önerilir. Test öncesinde vajinal duş veya derin genital yıkama yapılmamalı, antibiyotik kullanılmamalı ve cinsel ilişkide bulunulmamalıdır.