Da Vinci Şifresi romanı, İsa ile ilgili tarihi sırları ve Da Vinci'nin bu sırlarla ilgili ipuçlarını eserlerinde gizlediğini anlatır. Kitabın ana olayları şu şekilde özetlenebilir: 1. Paris'teki Louvre Müzesi'nin müdürü gizemli bir şekilde öldürülür ve arkasında şifreli ipuçları bırakır. 2. Harvard Üniversitesi'nde Sembolizm Profesörü olan Robert Langdon, bu sırları çözmek için çağrılır. 3. Langdon ve Fransız kriptolog Sophie Neveu, cinayetin gizemini çözmeye çalışırken, onları tarihin derinliklerinde kalan çok gizemli sırlara götürür. 4. Bu sırların en önemli ipuçları, Da Vinci'nin tablolarında gizlidir ve Langdon, Mona Lisa'nın bu şifreleri içerdiğini keşfeder. 5. Cinayeti işleyen kişi, güçlü bağlantılara sahip çok zeki biridir ve Langdon ile Neveu, onu durdurmak için bir kovalamaca içine girerler.