Sera drenajı iki şekilde yapılabilir: 1. İç drenaj: Sera içinde 3-10 metre aralıklarla, 30-40 cm genişlikte ve 70-80 cm derinlikte drenaj kanalları açılır. Kanalların dibi 5 cm kadar kumla doldurulur. Kumun üzerine drenaj künk veya boruları yerleştirilir. Boruların üzerine 5-10 cm yükseklik oluşturacak şekilde kum-çakıl karışımı döküldükten sonra, üzerleri toprakla kapatılır. Boruların bir ucuna kör tapa konur, diğer ucu sera dışındaki bir ana drenaj kanalına ya da kapalı bir toplayıcı ana drenaj borusuna bağlanır. 2. Dış drenaj: Seraların çevresinde, temel duvarları çevresinde bir drenaj sistemi yapılır. Bunun için, temel duvarlarından 100-150 cm uzaklıkta ve 75-100 cm derinlikte açılan hendeklere drenaj boruları döşenir. Drenaj için açılan hendeğin en altına 5 cm kalınlığında ince kum, bunun üzerine 10 cm çapında drenaj borusu yerleştirilir. Drenaj borusunun çevresi ince kumla sarılır ve bu kum, drenaj borusundan 10 cm daha yüksekliğe kadar devam eder. İnce kumun üzerine konulan çakılla drenaj hendeği doldurulur. Dış drenaj boruları birleştirilerek boşaltım hendeğine fazla taban suyu akıtılır. Sera drenajı yapılırken bir uzmana danışılması önerilir.