Sağlık Bilimleri Üniversitesi (SBÜ)'nde aşağıdaki bölümler bulunmaktadır: Fakülteler: Adana Tıp Fakültesi, Bursa Tıp Fakültesi, Çobanbey Tıp Fakültesi, Erzurum Tıp Fakültesi, Gülhane Diş Hekimliği Fakültesi, Gülhane Eczacılık Fakültesi, Gülhane Fizyoterapi ve Rehabilitasyon Fakültesi, Gülhane Hemşirelik Fakültesi, Gülhane Sağlık Bilimleri Fakültesi, Gülhane Tıp Fakültesi. Enstitüler: Gülhane Sağlık Bilimleri Enstitüsü, Hamidiye Sağlık Bilimleri Enstitüsü, Hamidiye Sporcu Sağlığı ve Spor Bilimleri Enstitüsü, Savunma Sağlık Bilimleri Enstitüsü. Yüksekokullar: Buhara İbni Sina Sağlık Hizmetleri Meslek Yüksekokulu, Çobanbey Sağlık Hizmetleri Meslek Yüksekokulu, Gülhane Sağlık Meslek Yüksekokulu, Hamidiye Sağlık Hizmetleri Meslek Yüksekokulu. Ayrıca, SBÜ'nün uluslararası tıp fakülteleri de bulunmaktadır.