Japonya'daki en ağır ceza, ölüm cezasıdır. Japonya Ceza Kanunu, iç savaş çıkarmak için komplo kurmak, yabancı bir güçle Japonya'ya karşı savaşı kışkırtmak için komplo kurmak, cinayet, demiryollarının, gemilerin veya uçakların çalışmasının engellenmesiyle sonuçlanan mağdurun ölümü, su kaynağının zehirlenmesi sonucu mağdurun ölümü, kasıtlı sel, bomba kullanımı ve bir konutun kundaklanması dahil olmak üzere 14 suç için ölüm cezası öngörmektedir. Uygulamada ise ölüm cezası yalnızca ağır cinayetler için geçerli olup ek olarak işkence veya fidye talebiyle adam kaçırma gibi durumlarda da tek kişinin öldüğü cinayetlere de verilebilmektedir.