Hatay Arkeoloji Müzesi'nde çeşitli dönemlere ait birçok önemli eser bulunmaktadır. Müzede sergilenen bazı eserler şunlardır: Mozaikler: Toplam 3250 m² alan kaplayan ve dünyanın en büyük mozaik koleksiyonuna sahip. Şuppiluliuma Heykeli: Amik Ovası'ndaki Tell Tayinat Höyük'te bulunan, Geç Hitit Krallığı dönemine ait bazalt taşından yapılmış devasa bir heykel. Antakya Lahdi: Roma dönemine ait, üzerindeki figürlerden mezarın saygın birine ait olduğu düşünülen bir lahit. Tyche Heykeli: Antakya'nın şehir surlarını, Asi Nehri'ni ve Habib-i Neccar Dağı'nı sembolize eden bir heykel. Arsuz Stelleri, Asur Ortastadı: Müzenin diğer dikkat çeken eserleri arasında yer almaktadır. Ayrıca, müzede Paleolitik, Neolitik, Kalkolitik, Tunç Çağı, Hitit, Hellenistik, Selçuklu ve Osmanlı dönemlerine ait eserler de sergilenmektedir.