Mardin mavi badem şekerinin mavi olmasının nedeni, doğal bitki kökü olan lahor ağacıdır. Bilimsel adıyla Haematoxylum campechianum, sıcak iklimlerde yetişen, doğal mavi-mor tonlarda boya içeren bir bitkidir. Sentetik boya içermediğinden, mavi badem şekeri 2-3 hafta içinde rengini biraz kaybeder. Bazı üreticiler, mavi rengi Mardin'in tarihi ve kültürel özellikleriyle bağdaştırdıklarını belirtirler. Ancak, bazı tatlı üreticileri de mavi renkli gıda boyalarının kullanımının sağlık açısından riskli olabileceğine dikkat çekmektedirler.