Mardin mavi badem şekerinin mavi olmasının nedeni, doğal bitki kökü olan lahor ağacıdır .
Bilimsel adıyla Haematoxylum campechianum, sıcak iklimlerde yetişen, doğal mavi-mor tonlarda boya içeren bir bitkidir . Kurutulmuş lahor kökü, suyla kaynatıldığında doğal mavi pigment elde edilir . Bu pigment, şekere ya da bademlere uygulanarak doğal renklendirme sağlanır .
Sentetik boya içermediğinden, mavi badem şekeri 2-3 hafta içinde rengini biraz kaybeder .
Bazı üreticiler, mavi rengi Mardin'in tarihi ve kültürel özellikleriyle bağdaştırdıklarını belirtirler . Örneğin, Mardin'deki Mor Gabriel Manastırı'nın ve bazı tarihi camilerin mavi mozaik süslemeleri bulunmaktadır .
Ancak, bazı tatlı üreticileri de mavi renkli gıda boyalarının kullanımının sağlık açısından riskli olabileceğine dikkat çekmektedirler . Bazı gıda boyaları, alerjik reaksiyonlara, hiperaktiviteye ve diğer sağlık sorunlarına neden olabilir .