Meyveli yoğurtta bulunan probiyotikler, yoğurtun türüne ve içeriğine bağlı olarak değişiklik gösterebilir. Örneğin, Sütaş Yovita meyveli yoğurt, Lactobacillus rhamnosus, Bifidobacterium longum ve Bifidobacterium lactis probiyotik bakterilerini içerir. Genel olarak, meyveli yoğurtlar probiyotik bakteriler olan Lactobacillus ve Bifidobacterium türlerini içerebilir. Probiyotik bakterilerin canlılığını korumak için, meyveli yoğurtların aşırı şeker içermemesi ve taze meyvelerle hazırlanması önerilir.