E-fatura için mali mühür gereklidir, e-imza ise yalnızca şahıs şirketleri için geçerlidir. Mali mühür, tüzel kişiliklerin (şirketlerin) elektronik fatura ve diğer e-dönüşüm uygulamalarından yararlanabilmesi için gereken elektronik mühürdür. E-imza, bireylerin elektronik ortamda ıslak imza yerine kullanabilecekleri, kişiye özel dijital kimlik doğrulama aracıdır. Dolayısıyla, şahıs şirketiniz varsa e-fatura kullanabilmek için mali mühür yerine e-imza kullanabilirsiniz.