Hacettepe Üniversitesi'nin yönetim sistemleri şunlardır: 1. Akademik Yapı: Üniversite, fakülteler, yüksekokullar, enstitüler ve araştırma uygulama merkezlerinden oluşur. 2. İdari Yapı: Rektör, Senato, Üniversite Yönetim Kurulu, rektör yardımcıları, genel sekreterlik, daire başkanlıkları ve şube müdürlükleri gibi birimlerden oluşur. 3. İç Kontrol Sistemi: 5018 sayılı Kanun çerçevesinde harcama birimleri, muhasebe ve mali hizmetler, ön mali kontrol ve iç denetimden oluşur. 4. Bilgi Yönetim Sistemleri: Elektronik hasta kayıtları, karar destek sistemleri, hemşire bilgi sistemleri ve ofis otomasyon sistemleri gibi teknolojileri içerir.