Shigella ve Shiga toksini arasındaki temel fark, Shigella'nın bir bakteri türü olması, Shiga toksini'nin ise bu bakteri tarafından salgılanan bir toksin olmasıdır 123.

Shigella, Enterobacteriaceae familyasına ait, gram negatif, fakültatif anaerobik, çubuk şeklinde ve hareketsiz bir bakteridir 25. Shiga toksini ise, Shigella dysenteriae ve bazı Escherichia coli bakterileri tarafından üretilen, hedef hücrelerde protein sentezini engelleyen bir toksindir 12.