Propofolün kimyasal yapısı 2,6-diizopropilfenol olarak tanımlanır. Molekül formülü C12H18O olup, molekül ağırlığı 178,27 g/mol'dür. Propofol, suda erimez ve yüksek derecede lipofiliktir; %98 oranında proteinlere bağlanır. Kimyasal olarak, %10 soya yağı, %2,25 gliserol ve %1,2 yumurta fosfotidlerinden elde edilen bir aköz solüsyon şeklinde de bulunabilir.