Primer biliyer kolanjit (PBC) ve primer sklerozan kolanjit (PSK) hastalarında farklı antikor seviyeleri yükselebilir: PBC'de: Antimitokondrial antikor (AMA). Alkalen fosfataz (ALP) ve gamma glutamil transferaz (GGT). PSK'de: Antinükleer stoplazmik antikor (ANCA). Antikardiolipin antikor (ACA). Antinükleer antikor (ANA). Serum komplement düzeyleri. Ayrıca, PSK hastalarının yaklaşık %95'inde anti-mitokondrial antikor (AMA) da saptanır. Bu antikorların varlığı, hastalığın tanısı için yapılan testlerin bir parçasıdır ancak kesin tanı için diğer klinik ve biyokimyasal bulguların da değerlendirilmesi gereklidir.