Primer biliyer kolanjit ve primer sklerozan kolanjitte yükselen antikorlar şunlardır: 1. Antinükleer stoplazmik antikor (ANCA): Bu antikor, primer sklerozan kolanjit hastalarının %65-85'inde pozitif bulunur. 2. Antikardiolipin antikor (ACA): Primer sklerozan kolanjitte %65 oranında artar. 3. Antinükleer antikor (ANA): Primer sklerozan kolanjit hastalarının %53'ünde yükselir. Ayrıca, primer biliyer kolanjit tanısında anti-mitokondriyal antikor (AMA) da önemli bir serolojik testtir ve hastaların yaklaşık %95'inde saptanır.