Pluripotent ve totipotent kök hücreler arasındaki temel fark, farklılaşma potansiyellerindedir: - Totipotent hücreler, embriyonik ve ekstraembriyonik dokular da dahil olmak üzere bir organizmadaki tüm hücre tiplerini oluşturma yeteneğine sahiptir. - Pluripotent hücreler ise tüm embriyonik hücreleri oluşturabilir, ancak ekstraembriyonik dokuları oluşturamazlar.