Maltitol, yüksek miktarlarda tüketildiğinde bazı zararlı etkilere yol açabilir: Gastrointestinal rahatsızlık: Maltitol, tam olarak sindirilemediği için şişkinlik, gaz ve ishal gibi sindirim sorunlarına neden olabilir. Kalori içeriği: Maltitol, gram başına 2,1 ila 3 kalori içerir, bu da kan şekerini etkileyebilir ve diyabet hastaları için dikkatli tüketilmesi gerektiğini gösterir. Maltitol içeren ürünleri tüketmeden önce, özellikle büyük miktarlarda tüketiliyorsa, vücudun nasıl tepki vereceğini gözlemlemek için küçük bir miktarla başlanması önerilir. Ayrıca, irritabl bağırsak sendromu (IBS) veya benzer gastrointestinal rahatsızlık belirtileri olan kişiler, maltitol ve diğer şeker alkollerinin semptomları kötüleştirebileceğini göz önünde bulundurmalıdır. Maltitolün güvenliği, FDA ve EFSA gibi düzenleyici kurumlar tarafından kabul edilmektedir.